El río madre de Dios desemboca en el Amazonas brasileño, pero nace en territorio peruano. A sus orillas se encuentra puerto Maldonado, la ciudad de mayor importancia en la selva sur del Perú.
Principales afluentes del río madre de Dios
Por la margen izquierda
Por la margen izquierda tenemos los ríos: Manu, río de las piedras y el Tahuamanu.
Por la margen derecha
Por esta margen tenemos los ríos: Inambari, y el Tambopata
